Перша частина гри «Ассасин 3» починається з нашого часу. Герой спочатку слухає розповідь від Дездемона, потім залишає фургон, прямуючи в печеру. Для відкриття входу в неї потрібно Яблуко Эдемена. По мірі просування вглиб цієї печери, герой виявляється на тренувальному полі.
Приводом для тренування стає оновлення прошивки для Анимуса. Управління тут аналогічно проходженню попередніх частин. Тут потрібно прискорене просування вперед, а також по уступах. Щоб дістатися до виходу, в повітрі необхідно здобути перемогу над двома ворогами.
Подальше просування вперед буде при грі за Кенуэя. Після проходження через двері, герой виявляється на балу. Як тільки він зайде в зал театру, йому потрібно зайняти собі місце ліворуч. Орлиний зір активується відразу після спілкування з союзником, після чого і виявиться мета на балконі справа в дальньому кінці. Тоді потрібно переміститися на те ложе, яке розташовується навпроти мети. Щоб потрапити за лаштунки потрібно зламати дверний замок - кожна з відмичок тут буде обертатися до характерного клацання. Злом завершиться натисканням відповідної кнопки.